A organização administrativa da Faculdade Modal está explicitada regimentalmente e tem como objetivo elevar a eficiência, eficácia e a efetividade do atendimento à comunidade acadêmica (corpo discente, corpo docente, corpo técnico-administrativo, mantenedores, etc.), através de seus diversos setores.
A política de administração é feita de forma democrática e participativa e conta com a representatividade da comunidade acadêmica e da sociedade civil através dos órgãos normativos, deliberativos, executivos, de apoio e suplementares.